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屋頂花園施肥的時間，應視植物生長情況和季節而定，生產上一般分基肥和追肥。
(1) 基肥的施用時期、
基肥分秋施和春施。秋施以秋分前后施入效果最好，此時正值根系又一次生長高峰，傷根后容易愈合，并可發新根；有機質腐爛分解的時間也較長，可及時為來年植物生長提供養分。春施基肥，如果有機質沒有充分分解，肥效發揮較慢，早春不能供給根系吸收，到生長后期肥效才發揮作用，往往造成新梢的2次生長，對植物生長發育尤其是對花芽分化和果實發育不利。
(2) 追肥的施用時期
當植物需追肥時就必須及時補充肥料，以滿足植物生長發育需要。具體追肥時間與樹種、品種習性以及氣候、樹齡、用途等有關，要緊緊根據各生育時期的特點進行追肥，如對觀花、觀果植物，花芽分化期和花后的追肥比較重要，而對大多數園林植物來說，1年中生長旺盛的抽梢追肥常常是必不可少的。追肥次數，對于一般初栽2-3年內的花木、庭蔭樹以及重點觀賞樹種，每年有必要在生長期進行1-2次追肥，至于具體時期則須視情況合理安排，靈活掌握。植物有缺肥癥狀時可隨時進行追肥。
